A Comissão de Vacinas da SIP-SPP elabora e atualiza periodicamente recomendações sobre vacinas não incluídas no Programa Nacional de Vacinação (PNV). Estas recomendações, baseiam-se na evidência científica mais recente sobre as características do microrganismo, as formas de apresentação e o impacto da doença nomeadamente a sua morbilidade, mortalidade e sequelas. Tem em conta a epidemiologia, particularmente a incidência da doença, os grupos etários mais atingidos, as estirpes em circulação e as caraterísticas da vacina: segurança, imunogenicidade, eficácia, concordância entre as estirpes em circulação e as contidas na vacina, efetividade e impacto, com avaliação da experiência de outros países. É dado um destaque particular a dados nacionais sempre que os mesmos existam. As análises de custo efetividade tal como são utilizadas na avaliação da introdução de uma vacina em PNV, não fazem parte do processo de elaboração destas recomendações.